Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms