Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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COL9A3Q14050 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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COL9A3Q14050 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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COL9A3Q14050 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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COL9A3Q14050 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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COL9A3Q14050 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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