Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNGB1Q14028 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGB1Q14028 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms