Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DDX39BQ13838 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms