Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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