Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC1Q13547 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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