Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
EIF4EBP1Q13541 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms