Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDAP1Q13442 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDAP1Q13442 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PDAP1Q13442 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDAP1Q13442 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDAP1Q13442 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDAP1Q13442 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDAP1Q13442 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDAP1Q13442 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDAP1Q13442 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDAP1Q13442 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms