Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AP3B2Q13367 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP3B2Q13367 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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