Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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