Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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