Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRPL28Q13084 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms