Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
STRN3Q13033 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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STRN3Q13033 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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