Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM2Q13029 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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