Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SYCNQ0VAF6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms