Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms