Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB2Q08289 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms