Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DHX9Q08211 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms