Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms