Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
GABPAQ06546 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABPAQ06546 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms