Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC103996.2-201ENST00000556763 915 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC093915.1-201ENST00000605740 1543 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC010834.3-201ENST00000520562 939 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms