Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIN1Q05586 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIN1Q05586 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms