Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTPN12Q05209 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms