Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3AQ05086 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms