Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms