Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DSC2Q02487 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms