Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms