Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHDQ02161 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHDQ02161 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHDQ02161 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RHDQ02161 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RHDQ02161 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RHDQ02161 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RHDQ02161 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms