Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XPCQ01831 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XPCQ01831 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XPCQ01831 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XPCQ01831 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms