Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A2Q01362 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms