Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTBN1Q01082 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms