Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF9Q00978 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms