Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLTCQ00610 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms