Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms