Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRB1P82279 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRB1P82279 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRB1P82279 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRB1P82279 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRB1P82279 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRB1P82279 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms