Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELF3P78545 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELF3P78545 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELF3P78545 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELF3P78545 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELF3P78545 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELF3P78545 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELF3P78545 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELF3P78545 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELF3P78545 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELF3P78545 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELF3P78545 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ELF3P78545 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELF3P78545 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELF3P78545 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELF3P78545 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELF3P78545 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELF3P78545 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELF3P78545 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELF3P78545 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms