Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2NP61088 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NP61088 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms