Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL3P58872 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL3P58872 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms