Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG3P56975 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NRG3P56975 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms