Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLDN12P56749 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms