Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms