Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AQP4P55087 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AQP4P55087 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AQP4P55087 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AQP4P55087 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AQP4P55087 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AQP4P55087 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AQP4P55087 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AQP4P55087 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AQP4P55087 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AQP4P55087 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AQP4P55087 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AQP4P55087 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AQP4P55087 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms