Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMD4P55036 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms