Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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