Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MVDP53602 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MVDP53602 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MVDP53602 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MVDP53602 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MVDP53602 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MVDP53602 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MVDP53602 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms