Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACLYP53396 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ACLYP53396 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ACLYP53396 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACLYP53396 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACLYP53396 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACLYP53396 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms