Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CX3CR1P49238 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CX3CR1P49238 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms