Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A3P48751 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms