Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP3P42574 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP3P42574 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP3P42574 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP3P42574 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP3P42574 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP3P42574 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP3P42574 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP3P42574 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP3P42574 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP3P42574 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP3P42574 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP3P42574 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms