Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNB1P35222 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms